Si os pasa como a mi que confundís git stash pop (aplica y borrar un stash) con git stash drop (que borra directamente), no lloreis aún. git stash drop imprime el hash del commit que estaba en stash y que hemos borrado, y con el puede recuperarse.

git stash drop
Dropped refs/stash@{0} (e692be2bc305348380c7c71a80867539babad3d7)

Si tienes el hash aún, puedes hacer simplemente:

git stash apply e692be2bc305348380c7c71a80867539babad3d7

Y salvarlo.

La verdad es que he pasado mal un ratillo.